[Galaxy-france] Fwd: [bioinfo] [formation] Bioinformatique - Analyse avancée de séquences

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[Galaxy-france] Fwd: [bioinfo] [formation] Bioinformatique - Analyse avancée de séquences

Dave Clements
Hello all,

Cross-posting from SFBI list.

Cheers,

Dave C


---------- Forwarded message ----------
From: <[hidden email]>
Date: 2015-04-24 9:26 GMT-07:00
Subject: [bioinfo] [formation] Bioinformatique - Analyse avancée de séquences
To: [hidden email]


Bonjour,

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) organise une formation en Bio-informatique intitulée : "Analyse avancée de séquences" à Bordeaux sur 3 jours du lundi 12/10/2015 au mercredi 14/10/2015:

Adresse:

Le Centre de Bioinformatique de Bordeaux est localisé au niveau principal du bâtiment du Centre de Génomique Fonctionnelle Bordeaux sur le site Carreire de l'Université Bordeaux Segalen (146, rue Léo Saignat 33076 Bordeaux cedex). Ce campus est situé à proximité du CHU Pellegrin.

Objectifs:

- Savoir rechercher des informations dans les banques de données
- Maitriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats
- Maitriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens
- Maitriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS)

Prérequis:

Aucun - Afin d'adapter au mieux le contenu de la formation aux attentes des stagiaires, il leur est demandé de compléter et de renvoyer le questionnaire qui sera prochainement téléchargeable sur le site du CNRS formation.

Programme:

 1er jour
- Organisation des banques de données publiques
- Recherche d'information dans des banques de données
- Comparaison et alignement multiple de séquences
- Familles de protéines et domaines fonctionnels

2ème jour
- Stratégie et enjeux de l'annotation de génomes
- Découverte des logiciels de prédiction
- Découverte des plateformes d'annotation en ligne
- Annotation d'un génome

3ème jour
- Etat de l'art du séquençage haut débit
- Formats et manipulation des données NGS
- Analyse avancée à partir de données NGS

Alternance de cours (10 h) et de travaux dirigés (10 h)

Une partie des analyses sera effectuée dans l'environnement Galaxy.

Les stagiaires sont invités à apporter leurs données qui seront utilisées, à des fins pédagogiques, pour les exercices de la dernière demi-journée.

Les inscriptions se font sur le site web du CNRS Formation indiqué ci-dessous:

https://cnrsformation.cnrs.fr/stage.php?stage=15274&axe=77

Pour toute information complémentaire (public visé, niveau, cout, ...), merci de contacter:

- Aurélien Barré ([hidden email])
- Raluca Uricaru ([hidden email])
- Benjamin Dartigues ([hidden email])


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Pour plus de lisibilité des offres d'emploi, merci de les poster en priorité
sur le site de la SFBI. Elles seront ainsi présentes sur le site et la liste
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http://www.sfbi.fr
Archives : http://listes.sfbi.fr/wws/arc/bioinfo




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