[Galaxy-france] Fwd: [bioinfo] Cycle d'aprentissage sous Galaxy

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[Galaxy-france] Fwd: [bioinfo] Cycle d'aprentissage sous Galaxy

Dave Clements
Hello all,

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Cheers,

Dave C


---------- Forwarded message ----------
From: Claire Hoede <[hidden email]>
Date: 2016-04-08 2:53 GMT-07:00
Subject: [bioinfo] Cycle d'aprentissage sous Galaxy
To: [hidden email]


Bonjour à tous,

Vous souhaitez vous former à l'analyse bioinformatique des données NGS sans utiliser la ligne de commande ?

Sigenae et la plateforme bioinfo genotoul vous propose 3 modules d'apprentissages indépendants vous permettant d'utiliser Galaxy (une interface web vous permettant de définir des pipelines d'analyses puis de les lancer sans utiliser la ligne de commande) pour le traitement de vos données issues de NGS.
Ces modules se dérouleront sur le site de l'INRA de Toulouse/Auzeville du 17 au 20 mai 2016.

17 mai :                                  Galaxy First Step : Cette journée est consacrée à une initiation à l'environnement Galaxy, puis à la prise en main de l'instance toulousaine et à l'apprentissage des bonnes pratiques d'utilisation.

18 et 19 mai (AM) :                Galaxy : alignment and variant calling : 1.5 jours de formation vous permettant de connaître les formats de fichiers manipulés, d'apprendre à aligner les reads sur un génome de référence et de détecter SNP et petits indels via la suite GATK.

19 mai (PM) et 20 mai (AM) : RNASeq alignment and transcrits assemblies : Il s'agit d'une journée de formation à l'analyse de données RNASeq. Après une introduction sur les données de transcriptomique issues des séquençages nouvelle génération, cette formation vous permettra d'effectuer un alignement épissé sur un génome de référence, de découvrir des nouveaux gènes et des nouveaux transcrits et enfin de quantifier leur expression.

Toutes les informations sont accessibles via notre site web : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php?id=10
Les inscriptions se font en ligne après avoir demandé un compte (si vous n'en avez pas déjà un) à partir du formulaire : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php?id=141.
Les tarifs sont détaillés ici : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php?id=115.

N'hésitez pas à faire suivre ce mail à toute personne potentiellement intéressée.

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Claire Hoede
INRA, MIAT & PF GenoToul Bioinfo
24 Chemin de Borde Rouge - Auzeville
CS 52 627
31326 Castanet Tolosan cedex

Tel : 33 (0) 5 61 28 53 05
email : [hidden email]
web : http://bioinfo.genotoul.fr



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Pour plus de lisibilité des offres d'emploi, merci de les poster en priorité
sur le site de la SFBI. Elles seront ainsi présentes sur le site et la liste
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